Resumen

Búsqueda de marcadores moleculares para la detección de cáncer de pulmón: análisis bioinformático de 40 perfiles de expresión génica

Marco conceptual

La bioinformática y el descubrimiento de biomarcadores de cáncer

SIGNATURE: análisis de la expresión génica

Materiales y métodos

Identificación de características comunes de expresión en las “firmas moleculares” de cáncer de pulmón

Extracción de los datos y agrupación jerárquica

Análisis de minería de datos

Expresión génica metasignature y análisis de supervivencia

Resultados y discusión

Identificación del metasignature de expresión génica y análisis de minería de datos

Vías de señalización biológicas enriquecidas (Kegg)

Módulos de expresión génica asociados con el metasignature

Regulación de la transición G1/S del ciclo celular “E2F3”

Regulación del punto de control del huso mitótico MAD2L1, BUB1B y CENP-A

Proteínas del complejo Polycomb y cáncer de pulmón

Significado clínico de ciclina B1 (CCNB1), ciclina B2 (CCNB2), ciclina A2 (CCNA2) y WEE en cáncer de pulmón

Relevancia pronóstica de la expresión de PCNA en cáncer de pulmón

Topoisomerasa II (TOPA2) y resistencia en cáncer de pulmón

Familia de proteínas Ras GTPasas

Influencia del gen transformante de tumores de pituitaria PPTG1 en cáncer de pulmón

Familia de genes MYC y cáncer de pulmón

Fosfoglicerato quinasa (PGK1) y cáncer de pulmón

Genes de reparación (MSH6, PCNA y RFC4)

Reparación del ADN y CP

Módulo de proteínas de matriz extracelular y metabolismo celular

Relevancia de las citoqueratinas y TTF-1 (NKX2-1) en cáncer de pulmón

Colágeno en CP

Proteína surfactante C (PS-C) para la detección de CP en sangre periférica

Cáncer de pulmón invasivo y expresión de la molécula de adhesión 1 (ICAM-1)

Expresión diferencial de la enzima superóxido dismutasa (SOD2) en cáncer de pulmón

Aldehído deshidrogenasa (ALDH1A1) y CP

Ontología

Ontología GO: procesos biológicos

Ontología GO: componente celular

Ontología GO: función molecular

Conclusiones

Referencias bibliográficas

Anexos

Vías de señalización biológicas enriquecidas en el metasignature